剧情介绍：名侦探柯南：远海的侦探，明朗季节，江户川柯南（平地南 配音）和毛利小五郎（小山力也 配音）、小兰（山崎和佳奈 配音）以及少年侦察团的同伴们一起离开都门，他们行将登上侵占队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的觉得，时期还结识了斑斓又有着几分秘密的女侵占队员藤井七海（柴咲幸 配音）。谁知康乐的空气很快被惊惧所代替，战舰上倏忽发明一条断掉的手臂，隐没的侵占队员又惹起军方的惊惧与猜想。本来某国秘密特工X已轻轻登上宙斯盾，乘机偷取战舰上的绝密谍报。　　为了找出隐蔽的敌手，柯南和灰原哀（林原惠美 配音）、阿笠博士（绪方贤一 配音）、服部平次（堀川亮 配音）以及远山和叶（宫村优子 配音）通力单干，与特工睁开连番斗智斗勇的比赛…